Vstup do katakomb je ze zadního traktu domu sv. Ignáce, který stojí na Masarykově náměstí. Katakomby jsou významnou historickou památkou města. Jejich celková délka činí 25 km a po Znojmu jsou druhé největší na území České republiky. Chodby jsou raženy ve skále v několika podlažích pod sebou.

Dlouho se historikové domnívali, že podzemní chodby jsou zbytky starých dolů na Stříbro. Další tvrdili, že podzemní chodby byly raženy pro vojenské účely. V současnosti převládá názor, že podzemní chodby vděčí za svůj vznik hospodářským důvodům. Jihlava ležela na důležité křižovatce středověkých obchodních cest a tak v době, kdy význam těžby Stříbra poklesl, začal se ve městě prudce rozvíjet obchod a řemesla. Kupci a řemeslníci si pro uskladnění svého zboží a výrobků rozšiřovali stávající sklepy, na jejichž prohlubování pracovali jihlavští horníci.

V roce 1978 zde byla amatérskými speleology objevena tzv. "svítící chodba". Stěny chodby jsou pokryty povlakem s obsahem sirníků zinku a barya, který po předchozím nasvícení zelenkavě světélkuje. Chodba se nachází asi 10 metrů pod povrchem země a je největší raritou a záhadou jihlavských katakomb.